Markuskirken er en blanding av bysantinsk, gotisk og romansk stil. Den er utformet som et gresk kors, og på toppen av det ligger fem store kupler som symboliserer Guds nærvær. Innvendig er det en visuell fryd med intrikate mosaikker, marmorgulv og overdådig innredning. Denne blandingen av design representerer Venezias bånd til Bysants.
Basilikaens luksuriøse interiør, med gylne mosaikker og symbolsk kunst, er en vakker blanding av østlig og vestlig arkitektonisk påvirkning. Det er et unikt arkitektonisk underverk som viser byens rike historie og kulturelle forbindelser.