Dans le hall d'entrée sud, la chapelle Zen rend hommage au cardinal Giambattista Zen. Il présente une porte cintrée en bronze du Ve siècle, partie de Constantinople, et un cycle de mosaïques illustrant la vie de saint Marc en 12 scènes. Ces scènes incluent la prophétie angélique sur l'enterrement de Saint-Marc à Venise et le droit divin de l'église à posséder ses reliques. Explorez d'autres chapelles comme la chapelle Saint Giovanni, qui illustre la vie de Saint Jean, et la Cappella della Vierge Nicopeia, qui abrite la célèbre icône byzantine de la Vierge Nicopeia.